Supper Protein Wire Model 彎曲機(jī)

Supper Protein Wire Model Bender?是一種通過(guò)在單根連續(xù)長(zhǎng)度的鋼棒中放置適當(dāng)?shù)膹澢鷣?lái)輕松制作蛋白質(zhì)分子的 α 碳骨架模型的裝置。這些模型可以制成任何比例，最小約為 4 毫米/?。在這種尺寸下，模型可以完全獨(dú)立，因此不需要外來(lái)支撐網(wǎng)絡(luò)。它們足夠小，只需要很少的存儲(chǔ)空間，并且足夠堅(jiān)固，可以承受頻繁的處理和研究。

已經(jīng)有幾種很好的蛋白質(zhì)模型可用，但它們都涉及將大量小塊準(zhǔn)確地連接在一起，因此構(gòu)建的費(fèi)用和難度限制了它們的使用。?幸運(yùn)的是，彎曲機(jī)生成的簡(jiǎn)單的一體式蛋白質(zhì)模型可以用于三維模型最有價(jià)值的許多功能。它們以異常清晰的方式展示了每種蛋白質(zhì)的整體折疊模式，特別適用于比較一個(gè)分子內(nèi)或同源蛋白質(zhì)之間具有相似結(jié)構(gòu)的區(qū)域。在骨架上添加配體和一些選定的側(cè)鏈后，這些模型顯示了酶活性位點(diǎn)的三維幾何形狀，這在生化實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)中通常很有用。這些骨架模型可用于教學(xué)目的，既可以作為課堂展品，也可以作為學(xué)生制作自己的蛋白質(zhì)模型來(lái)學(xué)習(xí)和保存的實(shí)驗(yàn)室練習(xí)。由于這些模型很小并且可以快速構(gòu)建，因此構(gòu)建每個(gè)已知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的模型是可行的。

彎曲器由杜克大學(xué)的 Byron H. Rubin 和 Jane S. Richardson 開(kāi)發(fā)（在美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院 Grant GM 15000 的支持下）。

無(wú)花果。（1） Rubredoxin，顯示鐵原子及其四個(gè)半胱氨酸配體。該模型由 1/8 英寸鋼棒彎曲并鍍鎳。它大約有 5 英寸高，比例為 4 毫米/?。

Rubredoxin，顯示鐵原子及其四個(gè)半胱氨酸配體。
該模型由 1/8 英寸鋼棒彎曲并鍍鎳。它大約有 5 英寸高，比例為 4 毫米/?。

用于構(gòu)建蛋白質(zhì) α-carbon 模型的彎曲器如下所示。該儀器由三個(gè)基本元件組成：一組兩個(gè)桿夾、一個(gè)旋轉(zhuǎn)砧和一個(gè)直讀彎錘。通過(guò)接合移動(dòng)夾具，松開(kāi)固定夾具，然后將移動(dòng)夾具推進(jìn)到向前擋塊，將固定長(zhǎng)度的 0.125 英寸或 3 毫米鋼棒送入彎曲砧座。該坐標(biāo)系由沿蛋白質(zhì)骨架的每個(gè)殘基的距離、二面角和彎曲角組成。連續(xù)的 α 碳 Cn-1 和 Cn 之間的距離由千分尺設(shè)置決定。始終將桿固定在兩個(gè)桿夾中的至少一個(gè)中，這樣就可以作為固定的參考系相對(duì)于彎曲機(jī)測(cè)量二面角。如果 An’ 是 Cn-2Cn-1Cn 平面和 Cn-1CnCn+1 平面之間的局部二面角，則彎曲砧鼓刻度盤上指示的累積二面角 An 為

桿通過(guò)彎曲錘刻度盤上讀取的彎曲角度 Bn 彎曲，并有少量的過(guò)沖，以允許鋼棒的彈性。

為了確保儀器的使用壽命，彎曲的砧座和錘子以及其他受力部件已硬化至洛氏 45 度。

每臺(tái)彎曲機(jī)在發(fā)貨時(shí)都提供了說(shuō)明材料。詳細(xì)描述了彎曲模型的過(guò)程。包括十種蛋白質(zhì)（胰島素、紅氧還蛋白、胰蛋白酶抑制劑、高電位鐵蛋白、細(xì)胞色素 b5、細(xì)胞色素 C、鯉魚(yú)肌瘤、葡萄球菌核酸酶、碳酸酐酶和乳酸脫氫酶）的彎曲角列表，并給出了截至 1972 年 5 月發(fā)表的那些蛋白質(zhì)坐標(biāo)集的文獻(xiàn)參考。

無(wú)花果。（2） 核糖核酸酶 S：S 蛋白和 S 肽的骨架位于 1/8“ 鋼棒中，二硫鍵位于 1/16” 線中。該模型是用彎曲器構(gòu)建的，比例為 6mm/?，寬約 10 英寸。